佳木斯海关于1991年9月5日正式建关。现辖区为佳木斯市、鹤岗市、双鸭山市、七台河市四个市及其所辖的桦川、桦南、汤原、友谊、勃利、宝清、集贤七个县和建三江、宝泉岭、红兴隆三个副局级国营农场。设有河港、铁路、民航机场(已经海关总署批准正式对外开放,未验收)三个监管现场。河港为国家一类口岸。辖区内有进出口经营权的企业共360户,其中外商投资企业175户。截止到2002年度年审结束,在我关注册有效的企业只有68户,其中外商投资企业18户。
佳木斯海关为正处级单位。现内设办公室、政工办、财务科、业务一科、业务二科和缉私分局(处级)。全关共有关员35 人(缉私警察11人),平均年龄36岁;副科级以上干部11人,平均年龄42岁。大专以上学历的人数占总人数的95%,党员24人,占干部总人数的80%。
建关十一年间,佳木斯海关共监管进出口货物95.6万吨,监管进出境运输工具6,591艘(辆、架)次,监管进出境旅客15万人次,征收关税及代征税8,446万元,减免关税7.8亿元,查获走私违规案值400多万元。
2002年,我关共征收税款614万,同比增长47%;共监管进出口货物2162吨,同比增长430%;审核进出口报关单48份,同比增长380%;进出口货物总值565万美元,同比增长391%;办理减免税共计1197万元;办理加工贸易备案合同进口金额596万美元。